iPhone 5s/5cには、最新のiOSである「iOS 7」が搭載されます。iOS 7ではデザインを一新し、これまでは立体的な表現や現実のものを忠実に再現するデザインが行われていましたが、より平面的で、抽象化された雰囲気に変更されました。操作上の大きな変更は、画面下部から上にスワイプして表示するコントロールセンターで、［設定］アプリを開かずに、Wi-Fiのオン／オフなどの機能を切り替えられます。また、カメラと写真のアプリが大幅に進化し、iPhone同士でデータをやりとりできる「AirDrop」という機能も新たに加わります。iOS 7はiPhone 4以降のiPhoneで利用可能です。