ペンには［蛍光ペン］と［ペン］の2種類があります。選択したペンの種類によってマウスポインターの形状が変化します。また、ペンより蛍光ペンの方が太い線が引けます。

初期設定では、ペンの色が赤色になっています。スライドショーの実行中に、［スライドショー］ツールバーのペンのメニューから［インクの色］をクリックしてペンの色を変更できますが、以下の手順で最初に表示されるペンの色を変更できます。スライドのテーマに合わせて目立つ色を選ぶと効果的です。ただし、蛍光ペンの色は事前に変更できません。

ペンを使ってスライドに書き込んだ内容はスライドと一緒に保存できます。ペンでスライドに書き込みをすると、スライドショーの終了時に「インク注釈を保持しますか？」というメッセージが表示されます。［保持］ボタンをクリックすると、書き込んだ内容が図形として保存されます。ただし、手順6のようにすべての書き込みを消去した場合には、メッセージは表示されません。

ペンのメニューに表示される［レーザーポインター］を選ぶと、マウスポインターの形状が赤く光ったようになります。この状態でスライド上を動かすと、スライドの文字や図形に注目を集められます。ただし、ペンのような書き込みはできません。スライドショーの実行中に［Ctrl］キーを押しながらスライド上をドラッグしても、レーザーポインターの機能を使えます。